روز چهارشنبه بیست‌وهفتم فروردین ماه، مصطفی مهرآئین، در پژوهشگاه محل کارش توسط حراست فراخوانده شده و از او خواسته‌اند که تمامی فعالیت‌های خود را متوقف کند.
گزارش‌ها حاکی از آن است که پس از مقاومت و مخالفت وی با این درخواست، او به دفتر مدیریت منتقل شده و به‌طور رسمی به او اعلام شده است که به دلیل نوشتن نامه‌هایش به علی خامنه‌ای و دیگر فعالیت‌های انتقادی، از هر نوع فعالیت از جمله نوشتن، مصاحبه و اقدامات مشابه منع شده است. در ادامه، به دکتر مهرآیین هشدار داده شده که در صورت بی‌توجهی به این محرومیت‌ها، حکم جلب او اجرا خواهد شد. گفتنی است، جامعه علمی و حقوق بشری نسبت به این موضوع ابراز نگرانی کرده و خواستار حمایت از دکتر مهرآیین و دیگر فعالان شده‌اند.