گزارشات منتشرشده در روز دوشنبه 11 فروردین ماه حاکی از آن است که علیه مصطفی مهرآیین جامعه شناس در دادسرای فرهنگ و رسانه پرونده قضایی تشکیل شد.
این پرونده در پی انتشار نامهای توسط مصطفی مهرآیین خطاب به خامنه ای رهبر جمهوری اسلامی علیه وی تشکیل شده و هماکنون در شعبه 9 دادسرای فرهنگ و رسانه تحت رسیدگی است.نامبرده در این نامه از سیاستهای خامنه ای در اداره کشور اعتراض کرده و پیشنهاداتی برای تغییر ساختار سیاسی ایران ارائه داده بود.او در این نامه همچنین خواستار آزادی زندانیان سیاسی، انحلال سپاه پاسداران، برگزاری رفراندوم، تغییر قانون اساسی و در نهایت کنارهگیری خامنه ای از قدرت شده بود.