در پی کاهش خروجی سد زایندهرود و قطع ناگهانی جریان آب در بخشهای پاییندست این رودخانه، هزاران قطعه ماهی و آبزی در حوضچهها و ماندابهای باقیمانده تلف شدند.
جریان آب زایندهرود پس از ۹۴ روز، از بامداد ۱۵ شهریور ۱۴۰۵ و همزمان با کاهش خروجی سد، در بخشهای پاییندست متوقف شد. قطع ناگهانی آب باعث شد شمار زیادی از ماهیان و بچهماهیان در ماندابهای کمعمق و زیر تابش شدید آفتاب گرفتار شوند. گفتنی است اهالی منطقه، شرکت آب منطقهای اصفهان را مسئول پیامدهای این شیوه مدیریت می دانند و خواستار برقراری جریانی حداقلی و دائمی در زایندهرود شدند.