برپایه گزارش منتشرشده اجرای طرح هوشمند سازی یارانه نان باعث بروز مشکلات عدیده‌ای از جمله معطلی شهروندان در صف‌های شلوغ نانوائی‌ها،کمبود نان،کسر آرد سهمیه صنف نانوایان و مشکلات دیگر شده است.
نانوایان در شهرهای لاهیجان،شیروان خراسان،کرمانشاه،کرمان و شیراز در اعتراض به کسر یارانه نان و کسر سهمیه ها و عملکرد نانینو اعتراض کردند.گفتنی است شرکت نانینو (ارائه‌دهنده دستگاه‌های هوشمند نانوایی) با این استدلال که نانوایان الگوی پخت نان را رعایت نکرده‌اند سهمیه آرد آنها را به طور قابل‌توجهی کاهش داده است.نانینو با قرار دادن یک دستگاه پوز در نانوایی‌ها تعداد نانی را که نانوا می‌پزد و در اختیار مردم قرار می‌دهد،کنترل می‌کند اما نمی‌داند که نانوا نمی‌تواند از تعدادی که مشتری می‌خواهد نان کمتری به او بدهد.گفتنی است که تعداد نانوایی‌ها در برخی از استان ها نسبت به جمعیت خیلی کمتر است و محدودیت سهمیه آرد در دراز مدت باعث تعطیلی بیشتر و شلوغ تر شدن صف نانوایی‌ها خواهد شد.