در پی تشدید تنش‌های جمهوری اسلامی با اسرائیل، ورودی کتابخانه ملی ایران به ایست‌بازرسی امنیتی تبدیل شده است.
به گفته شاهدان عینی، مأموران امنیتی حاضر در ورودی کتابخانه، بدون ارائه هیچ توضیحی، اقدام به بازرسی کیف، لپ‌تاپ، فلش، کتاب‌ها و جزوات همراه پژوهشگران می‌کنند. پژوهشگران، محققان و دانشجویان از رفتارهای تحقیرآمیز مأموران اطلاعاتی و تفتیش اجباری وسایل شخصی خود ابراز نارضایتی کرده‌اند. این نوع برخوردها یادآور سرکوب علمی دهه ۸۰ و ۹۰ است، زمانی که دانشجویان و محققان در محیط‌های آموزشی و پژوهشی دائماً تحت نظر بودند.